Przez całe wieki Burgundia, rządzona przez książąt z rodu Walezjuszów, zachowywała niezależność od Francji. Więcej – przez wieki była jedną z jej największych rywalek. W XVI wieku prowincja weszła w skład Francji, zachowując jednakże odrębność i liczne przywileje, ostatecznie zhołdował ją dopiero Ludwik XIV – Król Słońce – w drugiej połowie XVII wieku.

Już w średniowieczu była ośrodkiem życia handlowego, kulturalnego oraz religijnego, o czym świadczą zachowane perły romańskiej architektury sakralnej – przede wszystkim opactwa w Vézelay, Fontenay i Cluny.